Phí vận chuyển Shopee là khoản cước giao hàng và trả hàng mà sàn trừ vào tiền thanh toán của người bán, phải ghi nhận thành chi phí bán hàng trên sổ kế toán. Với 713.200đ trong báo cáo thu nhập tháng 6/2026, câu trả lời là có: phí vận chuyển Shopee vẫn phải lên bút toán dù sàn chưa xuất hóa đơn. Hóa đơn chỉ quyết định việc khấu trừ GTGT và chi phí được trừ, không quyết định việc ghi sổ.
Cách hạch toán phí vận chuyển Shopee dưới đây dành cho doanh nghiệp, không dành cho hộ kinh doanh. Bài viết đối chiếu từng dòng của báo cáo, nêu căn cứ pháp lý đã tra, rồi hướng dẫn định khoản Nợ/Có cho phí vận chuyển Shopee. Phần nào cần người chuyên môn xác nhận đều được ghi rõ.
Có phải hạch toán phí vận chuyển Shopee 713.200đ không?

Có. Khoản phí vận chuyển Shopee 713.200đ là chi phí thật của doanh nghiệp, nên phải hạch toán vào sổ tháng 6/2026, kể cả khi sàn chưa gửi hóa đơn. Điều 18 khoản 1 Luật Kế toán yêu cầu mọi nghiệp vụ phát sinh phải có chứng từ kế toán.
Ghi sổ và hóa đơn là hai việc khác nhau. Sổ kế toán phản ánh nghiệp vụ đã xảy ra. Hóa đơn chỉ quyết định thuế GTGT đầu vào có được khấu trừ và phí vận chuyển Shopee có được trừ khi tính thuế TNDN hay không.
Muốn hạch toán phí vận chuyển Shopee đúng, trước hết phải hiểu 713.200đ gồm những gì. Con số này là kết quả cộng trừ của sáu dòng trong mục “Phí vận chuyển (không tính trợ giá)” của báo cáo thu nhập Shopee, kỳ từ 01/06/2026 đến 30/06/2026.
| Dòng phí vận chuyển Shopee trên báo cáo | Số tiền (đồng) | Cách hiểu |
|---|---|---|
| Phí vận chuyển Người mua trả | 1.366.800 | Phần khách hàng trả |
| Phí vận chuyển thực tế | -25.851.400 | Cước thực tế của các đơn |
| Phí vận chuyển được trợ giá từ Shopee | 24.484.600 | Phần sàn hỗ trợ cước |
| Phí vận chuyển trả hàng (đơn Trả hàng/hoàn tiền) | -674.900 | Cước chiều hàng khách trả về |
| Phí vận chuyển được hoàn bởi PiShip | 337.700 | Phần cước trả hàng được hoàn lại |
| Phí vận chuyển trả hàng (đơn giao không thành công) | -376.000 | Cước đơn giao thất bại |
| Cộng phí vận chuyển Shopee | -713.200 | Chi phí ròng người bán chịu |
Ba dòng đầu của phí vận chuyển Shopee triệt tiêu nhau: 1.366.800đ khách trả cộng 24.484.600đ sàn trợ giá bằng đúng 25.851.400đ cước thực tế. Chiều giao hàng đi vì vậy không để lại chi phí ròng nào cho người bán trong kỳ này.
Ba dòng còn lại của phí vận chuyển Shopee tạo ra khoản chi thật: -674.900đ cộng 337.700đ rồi trừ 376.000đ bằng -713.200đ. Đó là phí vận chuyển Shopee ròng của đơn trả hàng và đơn giao không thành công, sau khi PiShip hoàn 337.700đ.
Khoản phí vận chuyển Shopee này chiếm khoảng 0,43% so với 164.357.140đ tổng tiền sản phẩm cùng kỳ. Số tiền nhỏ nhưng nguyên tắc ghi sổ phí vận chuyển Shopee không đổi theo quy mô.
Cả báo cáo khớp phép tính 164.357.140 – 7.003.497 – 713.200 – 42.810.112 = 113.830.331đ, đúng dòng tổng thanh toán đã chuyển. Mục phí giao dịch 42.810.112đ nằm ngoài phạm vi bài này.
Căn cứ pháp lý nào quy định hạch toán phí vận chuyển Shopee?

Hạch toán phí vận chuyển Shopee dựa trên ba lớp căn cứ: Luật Kế toán về chứng từ, chế độ kế toán doanh nghiệp về tài khoản, và pháp luật thuế về hệ quả của việc có hay không có hóa đơn. Bảng dưới đây ghi đích danh số hiệu, điều khoản và mốc hiệu lực áp vào phí vận chuyển Shopee.
| Văn bản | Điều khoản | Nội dung áp vào phí vận chuyển Shopee | Hiệu lực |
|---|---|---|---|
| Luật Kế toán (văn bản hợp nhất 41/VBHN-VPQH ngày 16/3/2026) | Điều 3 khoản 3; Điều 16; Điều 17; Điều 18 khoản 1 | Định nghĩa chứng từ kế toán, nội dung bắt buộc, chứng từ điện tử, nghĩa vụ lập chứng từ cho phí vận chuyển Shopee | Đang hiệu lực |
| Thông tư 99/2025/TT-BTC | Điều 31; Phụ lục II, tài khoản 641 và 521 | Phí vận chuyển Shopee thuộc tài khoản 641, cấp 2 là 6417 | Từ 01/01/2026 |
| Thông tư 133/2016/TT-BTC | Điều 2; Điều 64 | Doanh nghiệp nhỏ và vừa ghi phí vận chuyển Shopee ở tài khoản 642, cấp 2 là 6421 | Đang hiệu lực |
| Nghị định 320/2025/NĐ-CP | Điều 9 khoản 1 điểm b; Điều 24 khoản 1 | Phí vận chuyển Shopee được trừ khi có đủ hóa đơn, chứng từ; áp dụng từ kỳ tính thuế TNDN năm 2025 | Từ 15/12/2025 |
| Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15 | Điều 14 khoản 2 điểm a | Khấu trừ GTGT đầu vào cần hóa đơn GTGT mua dịch vụ | Từ 01/7/2025 |
| Nghị định 254/2026/NĐ-CP | Điều 4 khoản 1; Điều 9 khoản 4 điểm a; Điều 43 | Bên bán dịch vụ phải lập hóa đơn, hạn chậm nhất ngày 07 tháng sau với dịch vụ bán theo kỳ | Từ 01/7/2026 |
Thời điểm áp dụng cần nhìn đúng. Nghiệp vụ phát sinh trong tháng 6/2026, còn hóa đơn phí vận chuyển Shopee thường được lập từ ngày 01/7/2026 nên đối chiếu theo Nghị định 254/2026/NĐ-CP, có hiệu lực từ 01/7/2026 theo Điều 43. Kế toán cần ghi chú ngày lập từng hóa đơn phí vận chuyển Shopee.
Hai tên gọi cùng chỉ một khoản chi. Báo cáo Shopee gọi là phí vận chuyển trả hàng, còn trên sổ kế toán đó là chi phí bán hàng, chi tiết dịch vụ mua ngoài.
> “Các nghiệp vụ kinh tế, tài chính phát sinh liên quan đến hoạt động của đơn vị kế toán phải lập chứng từ kế toán.” (Điều 18 khoản 1 Luật Kế toán)
Báo cáo của sàn có làm chứng từ phí vận chuyển Shopee được không? Điều 17 khoản 1 Luật Kế toán coi chứng từ điện tử là chứng từ kế toán khi có đủ nội dung theo Điều 16. Báo cáo thu nhập Shopee có kỳ báo cáo, chủ tài khoản và số tiền từng khoản, nhưng chưa có chữ ký người lập, người duyệt theo điểm g khoản 1 Điều 16.
Vì vậy kế toán nên lập thêm phiếu kế toán nội bộ kèm báo cáo cho phí vận chuyển Shopee. Đây là đánh giá của VAR eCOM khi xử lý hồ sơ đối soát sàn, không phải câu chữ của văn bản, nên cần kế toán trưởng xác nhận.
Hệ quả thuế của phí vận chuyển Shopee nằm ở hai điều khoản. Điều 14 khoản 2 điểm a Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15 đặt điều kiện khấu trừ đầu vào là có hóa đơn GTGT mua dịch vụ. Điều 9 khoản 1 điểm b Nghị định 320/2025/NĐ-CP đặt điều kiện cho chi phí được trừ:
> “Khoản chi có đủ hóa đơn, chứng từ theo quy định của pháp luật.”
Ghi chứng từ phí vận chuyển Shopee thế nào?
Lập một phiếu kế toán nội bộ cho cả tháng, đính kèm báo cáo thu nhập Shopee và ghi đủ các ô bắt buộc theo Điều 16 Luật Kế toán. Riêng ô số hóa đơn của phí vận chuyển Shopee để trống cho đến khi nhận được hóa đơn của bên cung cấp dịch vụ.
| Ô trên phiếu kế toán phí vận chuyển Shopee | Ghi gì | Để trống không |
|---|---|---|
| Tên và số hiệu chứng từ | Ví dụ: Phiếu kế toán PKT-VC-062026 | Không được trống (điểm a) |
| Ngày lập | Ngày lập phiếu; ngày hạch toán là 30/06/2026 | Không được trống (điểm b) |
| Tên, địa chỉ đơn vị lập | Tên và địa chỉ công ty | Không được trống (điểm c) |
| Nội dung nghiệp vụ | Phí vận chuyển Shopee ròng của đơn trả hàng và đơn giao không thành công, kỳ 01/06 đến 30/06/2026 | Không được trống (điểm đ) |
| Số tiền | 713.200 đồng, kèm số tiền bằng chữ | Không được trống (điểm e) |
| Chữ ký | Người lập và người duyệt | Không được trống (điểm g) |
| Số và ký hiệu hóa đơn | Số hóa đơn của bên cung cấp dịch vụ | Để trống đến khi nhận hóa đơn |
| Thuế GTGT đầu vào | 0 đồng khi chưa có hóa đơn GTGT | Ghi 0, không tự tính thuế |
Cuối tháng chưa thấy hóa đơn phí vận chuyển Shopee không có nghĩa bên bán dịch vụ được miễn lập. Điều 4 khoản 1 Nghị định 254/2026/NĐ-CP buộc người bán dịch vụ lập hóa đơn điện tử giao cho người mua. Với dịch vụ thương mại điện tử, chuyển phát và logistic bán theo kỳ, hóa đơn được lập khi đối soát xong, chậm nhất ngày 07 của tháng sau theo Điều 9 khoản 4 điểm a.
Với kỳ tháng 6/2026, mốc chậm nhất là ngày 07/7/2026. Quá mốc này vẫn chưa có hóa đơn phí vận chuyển Shopee thì gửi yêu cầu xuất hóa đơn bằng văn bản cho bên cung cấp dịch vụ, tức Shopee hoặc đơn vị vận chuyển do sàn chỉ định.
Hạch toán phí vận chuyển Shopee vào tài khoản nào?

Ghi Nợ tài khoản chi phí bán hàng, chi tiết dịch vụ mua ngoài, và ghi Có tài khoản phải thu của sàn. Doanh nghiệp theo Thông tư 99/2025/TT-BTC dùng tài khoản 6417, doanh nghiệp theo Thông tư 133/2016/TT-BTC dùng tài khoản 6421 để hạch toán phí vận chuyển Shopee.
Khi hạch toán phí vận chuyển Shopee, doanh nghiệp nhỏ và vừa được chọn một trong hai chế độ và phải thực hiện nhất quán tối thiểu một kỳ kế toán năm theo Điều 31 Thông tư 99/2025/TT-BTC. Nguyên tắc tài khoản 641 tại Phụ lục II nêu rõ chi phí bán hàng gồm cả chi phí vận chuyển.
Quy trình hạch toán phí vận chuyển Shopee mỗi tháng gồm năm bước:
- Tải báo cáo thu nhập của kỳ và tách mục phí vận chuyển Shopee.
- Cộng trừ sáu dòng, xác nhận kết quả là -713.200đ.
- Lập phiếu kế toán nội bộ và định khoản phí vận chuyển Shopee vào chi phí bán hàng.
- Theo dõi hóa đơn phí vận chuyển Shopee đến chậm nhất ngày 07 tháng sau.
- Đối chiếu hóa đơn với phiếu kế toán, ghi số hóa đơn vào phiếu.
| Bước | Định khoản tham khảo cho phí vận chuyển Shopee | Số tiền (đồng) | Ghi chú |
|---|---|---|---|
| Ghi nhận phí vận chuyển Shopee ròng tháng 6/2026 | Nợ TK 6417 / Có TK 131 (chi tiết Shopee) | 713.200 | Theo Thông tư 133/2016/TT-BTC thay 6417 bằng 6421 |
| Hóa đơn đến, có tách riêng thuế GTGT | Nợ TK 133 / Có TK 6417 cho phần thuế | Theo hóa đơn | Phụ lục II, TK 641 tách thuế GTGT được khấu trừ vào Nợ TK 133 |
| Hóa đơn đến, không có thuế GTGT | Không điều chỉnh bút toán | 0 | Chỉ ghi số hóa đơn vào phiếu kế toán |
Bảng trên là cách ghi tham khảo, không trích nguyên văn từ văn bản. Việc đưa khoản phải thu của sàn vào tài khoản 131 là cách làm phổ biến, nhưng không có điều khoản nào chỉ đích danh sàn thương mại điện tử, nên kế toán trưởng cần chốt cách ghi phí vận chuyển Shopee.
Khi đối soát báo cáo sàn cho khách hàng, VAR eCOM tách riêng dòng phí vận chuyển Shopee ròng khỏi nhóm giảm giá và trợ giá, vốn là -7.003.497đ trong báo cáo này. Làm vậy số cuối kỳ khớp với tiền về và không lẫn chi phí vào giảm trừ doanh thu.
Về kê khai thuế, phí vận chuyển Shopee có hai điểm cần nhớ. Thứ nhất, chưa có hóa đơn nghĩa là chưa có thuế GTGT đầu vào để khấu trừ theo Điều 14 khoản 2 điểm a Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15. Thứ hai, khoản 713.200đ vẫn nằm trên sổ, nhưng khi quyết toán TNDN cần đủ hóa đơn, chứng từ theo điểm b khoản 1 Điều 9 Nghị định 320/2025/NĐ-CP.
Danh mục chi phí được trừ khi tính thuế TNDN giúp rà các khoản tương tự trước kỳ quyết toán. Kết luận về khấu trừ và chi phí được trừ của phí vận chuyển Shopee là số rủi ro cao, cần người chuyên môn duyệt trước khi áp cho khách.
Trường hợp nào hạch toán phí vận chuyển Shopee khác đi?
Có bốn trường hợp: đơn trả hàng, nhiều sàn, kỳ báo cáo lệch tháng dương lịch và doanh nghiệp áp dụng chế độ kế toán khác. Ở mỗi trường hợp, cách hạch toán phí vận chuyển Shopee đổi ở chi tiết tài khoản chứ không đổi nguyên tắc.
Đơn trả hàng: tách phí vận chuyển Shopee khỏi giá trị hàng trả
Báo cáo có hai khoản dễ nhầm với phí vận chuyển Shopee. Số tiền hoàn lại -7.188.340đ thường là giá trị hàng hoàn cho khách, ghi giảm doanh thu qua tài khoản 521 theo Phụ lục II Thông tư 99/2025/TT-BTC. Phí vận chuyển Shopee của đơn trả hàng, -674.900đ, là chi phí, ghi vào tài khoản 6417 và không gộp với khoản trên.
Nhiều sàn: tách phí vận chuyển Shopee theo từng gian hàng
Mỗi sàn đặt tên dòng phí một kiểu và chốt kỳ vào ngày khác nhau. Hãy mở chi tiết tài khoản 131 và 6417 theo từng sàn, từng gian hàng để theo dõi phí vận chuyển Shopee, thay vì gộp một dòng. Cách này giúp tính lãi lỗ theo sàn mà không phải bóc lại từ báo cáo.
Bài kế toán sàn thương mại điện tử mô tả thêm các nhóm việc cốt lõi của phí vận chuyển Shopee và các khoản sàn khác.
Kỳ báo cáo lệch tháng dương lịch
Báo cáo trong ví dụ khớp tháng. Với sàn chốt kỳ giữa tháng, hãy ghi phí vận chuyển Shopee theo ngày phát sinh của từng đơn, không theo ngày tiền về. Hóa đơn đến sau thì ghi số hóa đơn vào chứng từ, không sửa bút toán gốc.
Doanh nghiệp siêu nhỏ hoặc chế độ kế toán khác
Doanh nghiệp siêu nhỏ có thể theo chế độ kế toán riêng với mã tài khoản khác hai chế độ trên. Hãy xác nhận chế độ áp dụng với kế toán trưởng trước khi định khoản phí vận chuyển Shopee.
Câu hỏi thường gặp
Công ty bên em mới bán hàng trên sàn tmđt shopee từ t6/2026, anh/chị cho em hỏi một chút về các khoản chi phí mà bên shopee không xuất hóa đơn trên báo cáo tháng. Phần phí vận chuyển 713.200đ có làm bút toán hạch toán không?
Có. Phần phí vận chuyển Shopee 713.200đ phải lên bút toán Nợ chi phí bán hàng, Có phải thu sàn trong tháng 6/2026. Việc sàn chưa xuất hóa đơn không làm mất nghĩa vụ ghi sổ, chỉ ảnh hưởng thuế GTGT đầu vào và chi phí được trừ.
Shopee không xuất hóa đơn phí vận chuyển thì có được tính vào chi phí không?
Chưa chắc. Điểm b khoản 1 Điều 9 Nghị định 320/2025/NĐ-CP đòi hỏi phí vận chuyển Shopee có đủ hóa đơn, chứng từ theo quy định. Hãy xin hóa đơn phí vận chuyển Shopee trước, và nếu không có thì nhờ người chuyên môn đánh giá báo cáo của sàn cùng phiếu kế toán có đủ làm chứng từ hay không.
Phí vận chuyển Shopee ghi vào tài khoản 641 hay 642?
Doanh nghiệp theo Thông tư 99/2025/TT-BTC ghi phí vận chuyển Shopee vào tài khoản 641, cấp 2 là 6417. Doanh nghiệp theo Thông tư 133/2016/TT-BTC ghi tài khoản 642, cấp 2 là 6421. Chọn đúng chế độ trước rồi mới chọn tài khoản, và xem thêm cách hạch toán tài khoản 641.
Cước giao đi, trợ giá Shopee và phí người mua trả có phải hạch toán riêng không?
Nên theo dõi riêng để đối soát dù tổng bằng 0. Ba dòng 1.366.800đ, -25.851.400đ và 24.484.600đ của phí vận chuyển Shopee cộng lại bằng 0. Việc khoản khách trả là doanh thu hay khoản thu hộ cần người chuyên môn xác nhận.
Bao lâu sau khi hết tháng thì nhận hóa đơn phí vận chuyển Shopee?
Chậm nhất ngày 07 của tháng sau tháng phát sinh dịch vụ, theo Điều 9 khoản 4 điểm a Nghị định 254/2026/NĐ-CP, với dịch vụ bán theo kỳ và đã đối soát xong. Hóa đơn phí vận chuyển Shopee kỳ tháng 6/2026 vì vậy có mốc 07/7/2026.
Kết luận
Hạch toán phí vận chuyển Shopee 713.200đ là nghiệp vụ bắt buộc ghi sổ, còn hóa đơn quyết định hệ quả thuế. Căn cứ gồm Điều 18 khoản 1 Luật Kế toán, tài khoản 6417 của Thông tư 99/2025/TT-BTC hoặc 6421 của Thông tư 133/2016/TT-BTC.
Hai căn cứ thuế của phí vận chuyển Shopee là Điều 9 khoản 1 điểm b Nghị định 320/2025/NĐ-CP và Điều 14 khoản 2 điểm a Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15. Nội dung được cập nhật tháng 10/2026.
Muốn đọc tiếp về phí vận chuyển Shopee và các chi phí sàn khác, xem hướng dẫn kế toán bán hàng trên sàn thương mại điện tử, cách hạch toán tài khoản 641 và nhóm chi phí được trừ khi tính thuế TNDN. Nguồn chính thống để tra tiếp văn bản gốc: Tổng cục Thuế và Bộ Tài chính.

