Sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay cho người bán, vậy chủ shop có còn phải tự kê khai thuế nữa không? Đây là câu hỏi nhiều hộ kinh doanh trên Shopee, TikTok Shop đặt ra từ khi Nghị định 117/2025/NĐ-CP có hiệu lực. Từ 1/7/2025, các sàn có chức năng thanh toán buộc phải khấu trừ và nộp thay thuế giá trị gia tăng, thuế thu nhập cá nhân cho hộ, cá nhân kinh doanh bán hàng qua sàn.

Sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay không đồng nghĩa với việc người bán đã hoàn tất mọi nghĩa vụ thuế trong năm. Bài viết dưới đây giải thích rõ cơ chế khấu trừ, mức thuế áp dụng, và những việc người bán vẫn phải tự làm sau khi sàn đã trừ tiền.

Những điều cơ bản cần biết về sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay

Từ ngày 1/7/2025, Nghị định 117/2025/NĐ-CP chính thức có hiệu lực, quy định các sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay cho hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh bán hàng qua sàn. Toàn văn nghị định được đăng tải tại Cổng Thông tin điện tử Chính phủ.

Cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay hoạt động theo từng đơn hàng. Mỗi khi phát sinh doanh thu, sàn tự động trừ một tỷ lệ phần trăm thuế trước khi chuyển phần tiền còn lại về tài khoản người bán.

Người bán không cần tự nộp riêng phần thuế này cho từng đơn hàng phát sinh. Đây là điểm khác biệt lớn nhất so với cách khai thuế khoán hoặc tự kê khai trước đây.

Đối tượng áp dụng sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay là hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh bán hàng hóa hoặc dịch vụ qua sàn có chức năng thanh toán như Shopee, TikTok Shop, Lazada. Doanh nghiệp có tư cách pháp nhân tự kê khai thuế theo cơ chế riêng, không thuộc diện này.

Nắm rõ đối tượng áp dụng giúp người bán biết chắc mình có thuộc diện sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay hay không, trước khi bắt tay vào đối chiếu số liệu hàng tháng.

Mức khấu trừ và phạm vi áp dụng của sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay

Mức khấu trừ áp dụng theo tỷ lệ phần trăm trên doanh thu từng đơn hàng, không phải trên lợi nhuận. Với hàng hóa, tỷ lệ thuế giá trị gia tăng bị khấu trừ là 1% doanh thu.

Phần thuế thu nhập cá nhân đối với cá nhân cư trú bán hàng hóa qua sàn là 0,5% doanh thu. Hai khoản này được sàn trừ song song ngay khi tiền về, không tách riêng thời điểm nộp.

Cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay áp dụng cho cả doanh thu từ đơn hàng thành công và doanh thu từ các khoản thu hộ COD mà sàn quản lý dòng tiền. Đơn hàng bị hủy, hoàn trả trước khi đối soát sẽ không tính vào doanh thu chịu khấu trừ.

Một điểm cần lưu ý: sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay chỉ áp dụng với sàn có chức năng thanh toán tích hợp. Các kênh bán hàng cá nhân như Facebook, Zalo không có cơ chế nộp thay này, người bán trên các kênh đó vẫn phải tự kê khai toàn bộ.

Trước khi so sánh số liệu, người bán cần xác định rõ kênh nào thuộc diện sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay và kênh nào không, tránh nhầm lẫn khi tổng hợp doanh thu cuối kỳ.

Vì sao người bán cần hiểu rõ cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay

Nhiều chủ shop nhầm lẫn rằng một khi sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay xong, họ đã hoàn tất mọi nghĩa vụ với cơ quan thuế trong năm. Đây là hiểu lầm phổ biến dẫn đến bỏ sót kê khai doanh thu ngoài sàn.

Với hộ kinh doanh bán trên Shopee, TikTok Shop

Hộ kinh doanh bán đa sàn cần cộng gộp doanh thu từ tất cả các sàn cùng doanh thu bán ngoài sàn (nếu có) để xác định tổng doanh thu chịu thuế trong năm. Riêng phần sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay chỉ là phần đã tạm nộp trước, chưa phải số thuế cuối cùng.

Nếu tổng doanh thu thực tế thấp hơn mức đã bị khấu trừ tạm tính, hộ kinh doanh có quyền làm thủ tục hoàn phần chênh lệch qua cơ quan thuế quản lý trực tiếp.

Với doanh nghiệp và shop bán hàng đa sàn quy mô lớn

Với shop có doanh thu hàng tỷ đồng mỗi tháng trên nhiều sàn, việc đối chiếu số tiền sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay với sổ sách nội bộ trở thành công việc định kỳ hàng tháng, không thể làm thủ công bằng cách cộng trừ trên Excel.

Việc đối soát cần tách rõ từng khoản: doanh thu gộp trước khấu trừ, số thuế sàn đã trừ, phí sàn, và khoản thực nhận. Thiếu một bước đối chiếu, sổ sách kế toán và số liệu cơ quan thuế nhận từ sàn sẽ lệch nhau.

Trình tự xử lý khi sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay hàng tháng

Bước 1: Tải báo cáo khấu trừ từ trung tâm người bán

Mỗi kỳ đối soát, người bán cần vào mục tài chính hoặc thuế trên Seller Center của từng sàn để tải báo cáo chi tiết số tiền sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay theo từng đơn hàng.

Báo cáo này thể hiện rõ doanh thu gộp, tỷ lệ khấu trừ, và số tiền thực chuyển về tài khoản ngân hàng. Đây là chứng từ gốc để đối chiếu với sổ kế toán.

Bước 2: Gộp doanh thu trong và ngoài sàn để kê khai

Người bán cộng doanh thu đã bị sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay với doanh thu bán ngoài sàn (website riêng, Facebook, Zalo, cửa hàng offline nếu có) để ra tổng doanh thu chịu thuế cả năm.

Từ tổng doanh thu này, đối chiếu với ngưỡng doanh thu chịu thuế giá trị gia tăng và nghĩa vụ xuất hóa đơn theo quy định hiện hành để biết có phát sinh thêm nghĩa vụ hay không.

Bước 3: Quyết toán cuối năm và xử lý phần chênh lệch

Cuối năm, người bán quyết toán tổng số thuế phải nộp cả năm với tổng số đã bị sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay cộng số đã tự nộp thêm nếu có.

Nộp dư thì làm hồ sơ đề nghị hoàn thuế tại cơ quan thuế quản lý, tham khảo thủ tục tại Tổng cục Thuế. Nộp thiếu thì phải nộp bổ sung phần chênh lệch, kèm theo tiền chậm nộp tính theo số ngày trễ hạn.

Shopee, TikTok Shop trừ thuế thay 2026 có gì khác nhau?

Cả Shopee và TikTok Shop đều áp dụng chung nguyên tắc sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay theo Nghị định 117/2025/NĐ-CP, nhưng chu kỳ đối soát và cách hiển thị báo cáo trên hai nền tảng không giống nhau.

Shopee giải ngân theo ngày, số tiền thuế bị khấu trừ được thể hiện ngay trong từng dòng giao dịch của báo cáo tài chính người bán. TikTok Shop thường gộp theo chu kỳ giải ngân 7-15 ngày, khoản thuế bị trừ nằm trong báo cáo thanh toán tổng hợp theo kỳ.

Vì cách hiển thị khác nhau, người bán bán song song trên cả hai sàn cần tách riêng file đối soát cho từng sàn trước khi cộng gộp tổng doanh thu chịu thuế. Gộp nhầm dữ liệu giữa hai báo cáo là lỗi phổ biến khiến số liệu kế toán bị sai lệch.

Xem thêm hướng dẫn từng bước tại cách kê khai thuế trên sàn thương mại điện tử 2026 để nắm quy trình áp dụng cho cả hai nền tảng.

Dù chọn bán trên sàn nào, nguyên tắc sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay vẫn không đổi: thuế bị trừ trước theo tỷ lệ cố định, phần còn lại mới chuyển về tài khoản người bán.

Vì sao kế toán thông thường hay bỏ sót phần sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay

Kế toán chưa quen nghiệp vụ thương mại điện tử thường ghi nhận doanh thu theo số tiền thực về tài khoản ngân hàng, bỏ qua phần đã bị sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay ngay từ đầu. Cách ghi này khiến doanh thu trên sổ sách thấp hơn số liệu sàn báo cáo về cơ quan thuế.

Khi đối chiếu, chênh lệch giữa hai nguồn dữ liệu buộc chủ shop phải giải trình, mất thời gian và có thể bị xếp vào diện rủi ro cao nếu chênh lệch lặp lại nhiều kỳ liên tiếp.

Việc cần làm là xây dựng quy trình đối soát tách riêng từng khoản mục ngay từ đầu mỗi kỳ: doanh thu gộp, thuế sàn khấu trừ, phí hoa hồng, phí vận chuyển, thay vì chỉ nhìn vào số tiền cuối cùng chuyển về tài khoản.

VAR eCOM xây dựng quy trình chuẩn hóa dữ liệu và đối soát đa sàn riêng cho từng shop. Nhờ vậy, số liệu sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay khớp với sổ sách kế toán mỗi tháng, thay vì dồn lại xử lý vào cuối năm khi đã khó truy lại chứng từ gốc.

Tham khảo thêm cách chuẩn hóa đối soát tại bài kế toán bán hàng trên sàn thương mại điện tử để hiểu quy trình ghi nhận doanh thu đúng theo báo cáo gốc từ sàn.

Các câu hỏi thường gặp về sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay

Người bán online còn phải tự quyết toán thuế không?

Có. Sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay chỉ là khoản tạm nộp theo từng đơn hàng, không thay thế nghĩa vụ quyết toán cuối năm. Người bán vẫn phải tự tổng hợp doanh thu, so sánh với số đã nộp qua sàn, và xử lý phần chênh lệch nếu có.

Khấu trừ thuế thay ảnh hưởng gì đến shop online?

Ảnh hưởng rõ nhất là dòng tiền về tài khoản thấp hơn doanh thu gộp trên đơn hàng, vì phần thuế đã bị trừ trước. Shop cần điều chỉnh cách ghi nhận doanh thu trong sổ sách theo đúng doanh thu gộp, không ghi theo số tiền thực nhận, để tránh lệch số khi cơ quan thuế đối chiếu dữ liệu từ sàn.

Không đồng ý với số tiền sàn đã khấu trừ thì xử lý thế nào?

Người bán có quyền yêu cầu sàn xuất báo cáo chi tiết từng đơn hàng để đối chiếu. Nếu phát hiện sai lệch giữa số liệu sàn báo cáo và thực tế đơn hàng, có thể khiếu nại trực tiếp với bộ phận hỗ trợ người bán trước khi làm việc với cơ quan thuế quản lý.

Doanh thu bán ngoài sàn có bị tính chung với phần sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay không?

Có. Khi quyết toán, cơ quan thuế xét tổng doanh thu từ mọi kênh bán hàng trong năm, không tách riêng phần đã qua sàn và phần bán ngoài sàn. Đây là lý do người bán đa kênh cần một hệ thống ghi nhận doanh thu hợp nhất theo từng kỳ.

Người bán muốn kiểm tra lại nghĩa vụ hoàn thuế phần đã nộp dư có thể xem thêm tại thủ tục hoàn thuế cho người bán trên nền tảng TMĐT.

Sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay có áp dụng với mọi mức doanh thu không?

Có, cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay áp dụng theo từng đơn hàng phát sinh, không phân biệt doanh thu shop lớn hay nhỏ. Shop mới bán vài đơn mỗi ngày cũng bị trừ thuế song song với shop có hàng nghìn đơn, chỉ khác nhau ở tổng số tiền bị khấu trừ mỗi kỳ.

Quy định mới sàn TMĐT nộp thuế thay người bán so với trước đây có gì thay đổi

Trước ngày 1/7/2025, người bán trên sàn tự kê khai và tự nộp toàn bộ số thuế phát sinh, sàn chỉ đóng vai trò trung gian chuyển tiền. Không có cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay ngay tại nguồn như hiện nay.

Từ khi Nghị định 117/2025/NĐ-CP có hiệu lực, quy định mới sàn TMĐT nộp thuế thay người bán chuyển phần trách nhiệm tính và trích nộp thuế theo từng đơn hàng sang cho chính sàn thực hiện. Người bán vẫn đứng tên chịu thuế, chỉ khác ở khâu ai là bên trực tiếp nộp tiền vào ngân sách nhà nước.

Thay đổi này giúp cơ quan thuế thu đúng, thu đủ ngay từ khi phát sinh giao dịch, giảm tình trạng bỏ sót kê khai vốn phổ biến ở nhóm bán hàng online trước đây. Với người bán, lợi ích là bớt việc tính thuế thủ công cho từng đơn, nhưng đi kèm là yêu cầu phải theo dõi sát số liệu sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay để không bị động khi quyết toán.

Một số hộ kinh doanh từng quen thuế khoán có thể thấy dòng tiền về tài khoản thay đổi ngay tháng đầu áp dụng cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay, do phần thuế bị trừ trước thay vì nộp gộp một lần cuối kỳ như trước.

Về bản chất, sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay không làm tăng tổng số thuế phải nộp trong năm, chỉ thay đổi thời điểm và cách thức nộp so với trước đây.

Doanh thu càng lớn, mức độ ảnh hưởng của việc khấu trừ càng rõ

Với shop doanh thu vài trăm triệu đồng mỗi tháng, số tiền bị sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay mỗi kỳ có thể lên tới hàng chục triệu đồng. Nếu không đối chiếu định kỳ, chủ shop khó nhận ra ngay khi có sai lệch giữa số sàn báo cáo và số thực tế phát sinh.

Đây cũng là lý do nhóm hộ kinh doanh, doanh nghiệp thương mại điện tử đa sàn doanh thu lớn cần một quy trình đối soát bài bản, thay vì chỉ dựa vào số tiền cuối cùng chuyển về tài khoản ngân hàng mỗi ngày.

Câu hỏi thường gặp thêm: sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay có áp dụng hồi tố không?

Cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay chỉ áp dụng cho giao dịch phát sinh từ thời điểm nghị định có hiệu lực trở đi, không truy thu ngược cho các đơn hàng phát sinh trước đó theo cơ chế cũ. Doanh thu phát sinh trước thời điểm áp dụng vẫn xử lý theo quy định tại thời điểm giao dịch đó.

Lời kết

Sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay giúp giảm bớt việc tự tính thuế cho từng đơn hàng, nhưng không xóa bỏ trách nhiệm kê khai và quyết toán của người bán vào cuối năm. Hiểu đúng cơ chế sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay giúp chủ shop tránh nộp thiếu, tránh bị truy thu, và biết cách đòi lại phần nộp dư khi có.

Với shop bán đa sàn, đa kênh, việc đối soát số liệu sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay mỗi tháng là bước bắt buộc để số liệu kế toán khớp với dữ liệu cơ quan thuế nhận từ sàn.

VAR eCOM đồng hành cùng hộ kinh doanh và doanh nghiệp thương mại điện tử đa sàn trong việc chuẩn hóa đối soát, xử lý hồ sơ chi phí, và lập báo cáo quản trị theo từng shop, từng sàn.

Liên hệ VAR eCOM qua hotline 082 6868 007 để được tư vấn miễn phí cách kiểm tra lại số liệu sàn thương mại điện tử khấu trừ thuế thay của shop bạn trong kỳ gần nhất.