Shopee khấu trừ thuế là việc sàn tự trừ thuế GTGT và thuế TNCN trên từng đơn thành công của hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh, rồi nộp thay vào ngân sách. Với hàng hóa, Shopee khấu trừ thuế 1% GTGT và 0,5% TNCN trên doanh thu mỗi đơn, đúng như bạn đang hỏi. Đây mới là khoản tạm trừ, doanh thu cả năm từ 1 tỷ đồng trở xuống thì được hoàn lại.

Bài viết dành cho kế toán viên đang cầm sao kê của chủ shop, nên đi thẳng vào căn cứ, cách ghi sổ và các ngoại lệ. Phạm vi là giao dịch Shopee khấu trừ thuế từ 01/7/2026 trở đi, nội dung cập nhật tháng 10/2026.

Shopee khấu trừ thuế 1% GTGT và 0,5% TNCN có đúng không?

Có, với hàng hóa của hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh, Shopee khấu trừ thuế 1% GTGT và 0,5% TNCN trên doanh thu mỗi giao dịch. Đây là số thuế sàn trừ và nộp thay, chưa phải số thuế cuối cùng. Doanh thu cả năm từ 1 tỷ đồng trở xuống thì số đã trừ được hoàn lại.

Shopee khấu trừ thuế khi sàn có chức năng đặt hàng trực tuyến và chức năng thanh toán. Khoản 5 Điều 3 Nghị định 252/2026/NĐ-CP mô tả đó là nền tảng tham gia thu tiền, đối soát hoặc xác nhận thanh toán. Shopee giữ tiền đơn hàng rồi giải ngân cho người bán, nên thường thuộc nhóm này.

Câu hỏi nhắc tới sổ S01 khi Shopee khấu trừ thuế. Trong Thông tư 152/2025/TT-BTC, mẫu tương ứng là S1a-HKD, dành cho hộ không chịu thuế GTGT và không phải nộp thuế TNCN. Chọn mẫu này nghĩa là shop tự xác định doanh thu năm từ 1 tỷ đồng trở xuống.

Ngưỡng 1 tỷ đồng nằm ở Điều 3 và Điều 4 Nghị định 68/2026/NĐ-CP, đã được Nghị định 141/2026/NĐ-CP sửa từ 500 triệu lên 1 tỷ đồng, áp dụng từ 01/01/2026. Với shop này, Shopee khấu trừ thuế trước, cuối năm bạn đối chiếu rồi xin hoàn nếu doanh thu không vượt ngưỡng.

Căn cứ pháp lý nào quy định Shopee khấu trừ thuế?

Căn cứ để Shopee khấu trừ thuế gồm khoản 5 Điều 4 Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15 và Điều 43 đến Điều 46 Nghị định 252/2026/NĐ-CP. Nghị định 252/2026/NĐ-CP có hiệu lực từ 01/7/2026 và thay nghị định cũ về khấu trừ của sàn. Phía người bán, nơi Shopee khấu trừ thuế, áp dụng Nghị định 68/2026/NĐ-CP.

Khoản 5 Điều 4 Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15 là gốc của việc Shopee khấu trừ thuế:

> … nhà quản lý nền tảng số có chức năng thanh toán thực hiện khấu trừ, nộp thuế thay, kê khai số thuế đã khấu trừ cho hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh trên sàn thương mại điện tử, nền tảng số.

Điều 43 Nghị định 252/2026/NĐ-CP giao chủ quản nền tảng khấu trừ thuế GTGT và thuế TNCN trên mỗi giao dịch. Điều 44 chốt thời điểm Shopee khấu trừ thuế là lúc xác nhận giao dịch thành công và chấp nhận thanh toán. Điều 45 cho sàn khai số Shopee khấu trừ thuế theo tháng và bù trừ đơn hủy hoặc trả hàng.

Điều 46 khoản 3 chuyển quyền và trách nhiệm của người bán, kể cả khi Shopee khấu trừ thuế, sang Điều 13 Nghị định 68/2026/NĐ-CP. Có một bẫy khi tra cứu: Điều 11 khoản 1 Nghị định 68/2026/NĐ-CP vẫn viện dẫn một nghị định cũ về khấu trừ của sàn. Tuy nhiên Điều 74 Nghị định 252/2026/NĐ-CP đã thay nghị định đó từ 01/7/2026.

Vì vậy hãy nhìn ngày phát sinh giao dịch. Từ 01/7/2026, Shopee khấu trừ thuế theo Nghị định 252/2026/NĐ-CP, còn giao dịch trước mốc này thuộc văn bản cũ đã hết hiệu lực nên bài không dẫn.

Từ 01/7/2026, Điều 44 không ghi sẵn con số mà dẫn về pháp luật thuế, nên mức Shopee khấu trừ thuế phải tra ở luật. Con số 1% lấy từ điểm b1 khoản 2 Điều 12 Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15. Con số 0,5% lấy từ điểm b khoản 3 Điều 7 Luật Thuế TNCN 109/2025/QH15.

Shopee khấu trừ thuế theo tỷ lệ nào với từng loại giao dịch?

Mức Shopee khấu trừ thuế phụ thuộc loại hoạt động: hàng hóa chịu 1% GTGT và 0,5% TNCN, dịch vụ chịu 5% và 2%, vận tải hoặc dịch vụ gắn với hàng hóa chịu 3% và 1,5%.

Mức Shopee khấu trừ thuế ở bảng trên có nguồn như sau. Cột GTGT lấy từ điểm b khoản 2 Điều 12 Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15. Cột TNCN lấy từ điểm b, c, d khoản 3 Điều 7 Luật Thuế TNCN 109/2025/QH15.

Ghi hóa đơn và chứng từ Shopee khấu trừ thuế thế nào?

Khoản Shopee khấu trừ thuế không làm giảm doanh thu ghi sổ. Bạn ghi doanh thu theo số tiền bán hàng người bán được hưởng do sàn thu hộ, kể cả phần Shopee khấu trừ thuế. Cơ sở là khoản 2 Điều 44 Nghị định 252/2026/NĐ-CP và điểm b khoản 1 Điều 8 Nghị định 68/2026/NĐ-CP.

Hai nghĩa vụ này tách bạch: việc Shopee khấu trừ thuế thuộc về sàn, còn người bán lo việc hóa đơn. Dù Shopee khấu trừ thuế, khoản 5 Điều 8 Nghị định 68/2026/NĐ-CP (sửa bởi Điều 1 Nghị định 141/2026/NĐ-CP) vẫn bắt buộc dùng hóa đơn điện tử có mã khi doanh thu năm trên 1 tỷ đồng. Từ 1 tỷ đồng trở xuống thì đăng ký khi có nhu cầu và đủ điều kiện.

Bảng sau cho biết từng ô trên sổ ghi gì, ô nào để trống khi Shopee khấu trừ thuế.

Mẫu S1a-HKD nằm ở khoản 1 Điều 4, mẫu S2a-HKD nằm ở khoản 2 Điều 5 Thông tư 152/2025/TT-BTC. Sổ S1a-HKD được mở để xác định hộ có thuộc diện chịu thuế GTGT, nộp thuế TNCN hay không, nên doanh thu phải ghi đủ dù Shopee khấu trừ thuế.

Phí sàn, voucher và trợ giá ảnh hưởng thế nào đến doanh thu tính thuế khi Shopee khấu trừ thuế thì cần đối chiếu sao kê từng kỳ. Bài chưa tìm thấy hướng dẫn riêng cho phần này nên không đưa con số. VAR eCOM đối chiếu ba nguồn là sao kê ví, báo cáo doanh thu của sàn và dữ liệu thuế điện tử để tìm phần chênh.

Hạch toán và kê khai Shopee khấu trừ thuế vào đâu?

Hộ kinh doanh ghi sổ theo mẫu, không định khoản Nợ và Có. Khoản Shopee khấu trừ thuế được đối chiếu khi kê khai: doanh thu năm từ 1 tỷ đồng trở xuống thì thông báo doanh thu thực tế trước ngày 31/01 năm sau, trên 1 tỷ đồng thì khai theo quý.

Thông tư 152/2025/TT-BTC hướng dẫn ghi sổ theo các mẫu S1a, S2a, S2b và S2c. Bài không tìm thấy quy định định khoản Nợ và Có cho khoản Shopee khấu trừ thuế, nên hãy theo dõi trên một bảng đối chiếu riêng.

Cách kê khai theo từng mức doanh thu như sau:

1. Từ 1 tỷ đồng trở xuống: dù Shopee khấu trừ thuế vẫn thông báo doanh thu thực tế chậm nhất ngày 31/01 năm sau (điểm a khoản 1 Điều 8 Nghị định 68/2026/NĐ-CP).
2. Vượt 1 tỷ đồng trong năm: khai thuế, nộp thuế từ quý phát sinh doanh thu vượt ngưỡng (cùng điều khoản).
3. Trên 1 tỷ đồng đến 50 tỷ đồng: khai GTGT theo quý, hạn nộp là ngày cuối cùng của tháng đầu quý sau (khoản 1 Điều 10 và điểm a khoản 3 Điều 8 Nghị định 68/2026/NĐ-CP).
4. Trên 50 tỷ đồng: khai GTGT theo tháng, hạn nộp chậm nhất ngày thứ 20 của tháng sau (điểm b khoản 3 Điều 8 cùng nghị định).

Với khoản Shopee khấu trừ thuế này, mẫu tờ khai và chỉ tiêu thực hiện theo hướng dẫn của Bộ trưởng Bộ Tài chính (khoản 5 Điều 11 Nghị định 68/2026/NĐ-CP). Bài chưa tìm thấy thông tư hướng dẫn mẫu này nên không nêu số chỉ tiêu. Thao tác trên cổng thuế điện tử có ở bài cách kê khai và nộp thuế sàn TMĐT cho hộ kinh doanh.

Trường hợp nào Shopee khấu trừ thuế khác đi?

Có bốn trường hợp khiến Shopee khấu trừ thuế lệch phép tính 1% và 0,5%: đơn hủy hoặc trả hàng, doanh thu năm từ 1 tỷ đồng trở xuống, bán nhiều kênh vượt 3 tỷ đồng và giao dịch không phân loại được.

Đơn hủy hoặc trả hàng thì Shopee khấu trừ thuế ra sao?

Khoản Shopee khấu trừ thuế cho đơn hủy hoặc trả hàng được bù trừ hoặc trả lại. Điều 45 khoản 2 Nghị định 252/2026/NĐ-CP cho sàn bù trừ số thuế của giao dịch này với số thuế phải nộp thay. Điều 46 khoản 1 điểm d yêu cầu sàn trả đầy đủ, kịp thời số thuế đã khấu trừ.

Khi đối soát khoản Shopee khấu trừ thuế, hãy đặt báo cáo đơn hoàn của sàn cạnh sao kê ví. Đơn hoàn kỳ này có thể được bù vào kỳ sau, nên số tiền về từng tháng không khớp phép tính theo từng đơn.

Doanh thu cả năm từ 1 tỷ đồng trở xuống thì Shopee khấu trừ thuế có được hoàn không?

Có. Khoản 1 Điều 12 Nghị định 68/2026/NĐ-CP, sau khi sửa ngưỡng thành 1 tỷ đồng, cho hộ có doanh thu thực tế năm từ 1 tỷ đồng trở xuống được bù trừ hoặc hoàn trả số thuế nộp thừa. Khoản 5 cùng điều xác định nơi nộp hồ sơ là cơ quan thuế nơi chủ hộ cư trú.

Bán đa sàn hoặc bán thêm ngoài sàn thì Shopee khấu trừ thuế tính thế nào?

Mỗi sàn khấu trừ riêng theo giao dịch của sàn đó, nên Shopee khấu trừ thuế chỉ trên đơn của Shopee, còn ngưỡng doanh thu tính trên cả năm. Điểm b khoản 1 Điều 8 Nghị định 68/2026/NĐ-CP tính doanh thu năm gồm cả phần đã được sàn khấu trừ, nộp thay. Doanh thu bán ngoài sàn phải cộng vào.

Khoản 3 Điều 11 cùng nghị định yêu cầu tổng hợp doanh thu để quyết toán TNCN khi doanh thu năm tổng hợp trên 3 tỷ đồng. Số TNCN mà Shopee khấu trừ thuế được trừ khi xác định số TNCN phải nộp.

Giao dịch không phân loại được là hàng hóa hay dịch vụ thì Shopee khấu trừ thuế bao nhiêu?

Shopee khấu trừ thuế theo mức cao nhất. Điểm b khoản 2 Điều 44 Nghị định 252/2026/NĐ-CP quy định nếu sàn không xác định được giao dịch là hàng hóa hay dịch vụ, số thuế phải khấu trừ tính theo mức tỷ lệ cao nhất. Vì vậy mô tả ngành hàng trên gian hàng cần chính xác.

Làm sao tính giá bán khi Shopee khấu trừ thuế?

Tách hai việc: tiền về sau khi sàn trừ thuế, và số thuế thật phải nộp cuối năm. Với hàng hóa, Shopee khấu trừ thuế tổng cộng 1,5% doanh thu từng đơn, nhưng số Shopee khấu trừ thuế này chỉ là tạm trừ. Giá bán nên tính theo thuế thật trên doanh thu năm dự kiến.

Ví dụ một đơn hàng hóa 200.000 đồng. Shopee khấu trừ thuế GTGT 2.000 đồng (1%) và thuế TNCN 1.000 đồng (0,5%), tổng 3.000 đồng, chưa tính phí sàn. Tiền về tài khoản giảm đúng 3.000 đồng so với giá trị đơn.

Shop có doanh thu năm 800 triệu đồng bị Shopee khấu trừ thuế tạm 12 triệu đồng, tức 800 triệu nhân 1,5%. Nếu doanh thu thực tế cả năm vẫn từ 1 tỷ đồng trở xuống, số Shopee khấu trừ thuế này thuộc diện được hoàn. Đừng cộng 12 triệu đồng vào giá vốn khi chưa chắc đó là chi phí thật.

Câu hỏi thường gặp về Shopee khấu trừ thuế

Cả nhà cho mình hỏi chút ạ: Mình đang chuẩn bị bán hàng trên Shopee thì đc CB thuế tư vấn đky cá nhân KD trên dv công và ghi sổ S01. Vậy cho mình hỏi Shopee sẽ tự động trừ thuế của mình là 1% thuế GTGT và 0,5% thuế TNCN đúng ko ạ? Mình muốn biết để còn thiết kế giá bán sp cho phù hợp? Cảm ơn mn ạ!

Đúng với hàng hóa: Shopee khấu trừ thuế 1% GTGT và 0,5% TNCN trên doanh thu mỗi đơn. Sổ bạn ghi nhiều khả năng là mẫu S1a-HKD của hộ doanh thu từ 1 tỷ đồng trở xuống. Khoản Shopee khấu trừ thuế chỉ là tạm trừ và được hoàn cuối năm nếu doanh thu không vượt ngưỡng, nên đừng cộng thẳng vào giá bán.

Shopee khấu trừ thuế rồi có phải kê khai thêm không?

Có, dù Shopee khấu trừ thuế rồi. Điểm b khoản 1 Điều 8 Nghị định 68/2026/NĐ-CP tính doanh thu năm gồm cả phần sàn đã khấu trừ, nên vẫn phải thông báo hoặc kê khai. Khi rà hồ sơ chủ shop bán trên sàn, VAR eCOM ghi nhận một hiểu lầm lặp lại là cho rằng sàn đã khấu trừ nghĩa là xong nghĩa vụ.

Sổ S1a-HKD và S2a-HKD khác nhau ở đâu?

S1a-HKD dành cho hộ không chịu thuế GTGT, không phải nộp thuế TNCN, chỉ có ba cột: ngày, diễn giải, số tiền (khoản 1 Điều 4 Thông tư 152/2025/TT-BTC). S2a-HKD dành cho hộ nộp thuế theo tỷ lệ phần trăm trên doanh thu, có thêm cột số hiệu và ngày tháng chứng từ (Điều 5 cùng thông tư). Cả hai sổ đều ghi doanh thu trước khi Shopee khấu trừ thuế.

Doanh nghiệp bán trên Shopee có bị Shopee khấu trừ thuế không?

Điều 43 khoản 1 Nghị định 252/2026/NĐ-CP chỉ nêu hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh, còn khoản 2 nêu nhà cung cấp nước ngoài. Điều này không nhắc doanh nghiệp trong nước, nên cơ chế 1% và 0,5% trong bài không áp cho nhóm đó. Doanh nghiệp vẫn tự kê khai theo luật thuế của mình, không qua cơ chế Shopee khấu trừ thuế.

Kết luận

Shopee khấu trừ thuế 1% GTGT và 0,5% TNCN là đúng với hàng hóa của hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh, căn cứ khoản 5 Điều 4 Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15 và Điều 43, Điều 44 Nghị định 252/2026/NĐ-CP. Đó là khoản Shopee khấu trừ thuế tạm tính trên từng đơn, không thay nghĩa vụ ghi sổ và kê khai.

Doanh thu năm từ 1 tỷ đồng trở xuống thì số Shopee khấu trừ thuế được hoàn theo khoản 1 Điều 12 Nghị định 68/2026/NĐ-CP. Hãy kiểm lại ngày phát sinh giao dịch để chọn đúng văn bản trước khi đối chiếu. Số liệu gốc tra tại cổng của Cục Thuế và Cổng Thông tin điện tử Chính phủ.

Bài liên quan: Nghị định 68 về kê khai thuế hộ kinh doanh 2026, thủ tục hoàn thuế cho người bán trên nền tảng TMĐT 2026 và danh mục 7 loại sổ kế toán hộ kinh doanh.